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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核微生物工程mRNA中最大要的转录后体现,在真核微生物工程的方面的问题和生物学时中起着至关重点的用。血糖值高的认知能力功能障碍是种不不可逆转的中枢面神经面神经体系退行性皮肤疾病,日前发展壮大更何况切逻辑未能非常阐释,并缺少高效的预防措施和诊疗方法手段。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱怪物为其提供m6A甲基化研究分析能力提供服务,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

优秀文章种类:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

客人企业单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

深入分析用料:小鼠脑组织

拜谱展示 系统:m6A甲基化(MeRIP-seq)

引言图:

图1| 引言图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

深入分析的结果

1.DCI小鼠海马中m6A表观遗传突显的改进

理论的研究考生管理第一步树立了高脂飲食和判断能力问题(DCI)的小鼠建模 。为更加相较比较组(n = 3)和DCI组(n = 3)左右的m6A染色体遗传修饰语,理论的研究考生管理选择MeRIP-seq进行了转录组位置内的m6A-seq讲解。在DCI组的10664个简码染色体遗传转录物(mRNAs)中国共产党出现 相较比较组的237一不相同的m6A峰。不同之处下,DCI组的表现出23,77个非相同m6A峰。这之中,9347个甲基化染色体遗传在相较比较组和DCI组左右相同(图2)。

图2| 比组和DCl组m6a体现遗传基因的维恩图

共监定出1279个差别的甲基化的m6A位点(DMMSs),这里面60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化的水平有所不同于明显高出比较组。概述其布局问题看见m6A峰布局在一小部分RNA中(图3A),并随着其布局的转录位置内中划分为接下来五组:5'UTR、3'UTR、转录启始位点位置内中细节描写、中断密匙子细节描写、启始密匙子细节描写和识别码回文序列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和中断密匙子付近明显生物富集(图3B)。要想分析评估方法等什么是表观遗传上m6A淡化语的位置内中,钻研人数筛分了有峰标注的位置内中,并旋光度的测定了等什么是表观遗传上reads的重叠率。在DCI组中,m6A淡化语区看中于3'UTR区(图3C)。所有的mRNA内的DMMS都被位置到染色剂剂体上来分析评估方法其布局概述。有所不同于小鼠染色剂剂体的m6A淡化语谱有所不同于。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的提升

为定期检查m6A掩盖在DCI小鼠中的动物工程学功用,研究阐述拜谱生物从两列选取择含DMMS的蛋白质含量质编写代码DNA对其进行GO和KEGG阐述(图4A)。在GO阐述中,高甲基化DNA在上皮細胞步骤、动物工程步骤调节、离子液体几丁质酶和杂环氧化物依照中有关系数聚集。KEGG4g的网络信号径路阐述体现,高甲基化DNA与T上皮細胞多巴胺肾上腺素受体4g的网络信号4g的网络信号径路、小上皮細胞肺腺癌和RIG-I样多巴胺肾上腺素受体4g的网络信号4g的网络信号径路有关(图4B)。相对低甲基化DNA,GO阐述体现在上皮細胞步骤、细胞代谢步骤和依照步骤中有关系数聚集充分环氧化物、依照杂环氧化物和离子液体几丁质酶(图4C)。KEGG4g的网络信号径路阐述具体分析了低甲基化DNA与肥厚性心肌病和Hippo4g的网络信号4g的网络信号径路的关联性(图4D)。

图4| 差异性甲基化m6A位点的环路聚集

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据文件的协同进行分析

后来学习师将m6A MeRIP-Seq的统计数值和原本RNA-Seq的统计数值采取联动研究分析,表明163个mRNA,m6A峰和mRNA总体质量同质性改善。41种mRNA的m6A和mRNA总体质量上涨,14种mRNA总体质量变动。除外,30个dnamRNA形容方法上涨,m6A总体质量变动,76个dnamRNA形容方法变动,m6A总体质量上涨(图5A)。末尾,实现半个个PPI网来表明163个dna商品编号的血清中的无线连接(图5B)。

如图所示6如图所示,GO和KEGG介绍可分四组:(1) m6A调涨,mRNA调整;(2) m6A调涨,mRNA调涨;(3) m6A调整,mRNA调整;(4) 人类染色体m6A调整和mRNA调涨。在GO介绍中,m6A调涨和mRNA调整的人类染色体在人体癌内部基础分解消化吸收转化转化的整个环节、香熏族单质生物制品组成的整个环节和RNA基础分解消化吸收转化转化的整个环节的干预中重要生物生物生物丰度。KEGG介绍表示,这样的人类染色体在油脂的酸基础分解消化吸收转化转化、小人体癌内部肝癌、丙酸基础分解消化吸收转化转化和甲苯酸基础分解消化吸收转化转化中生物生物生物丰度。而言m6A调涨和mRNA调涨的人类染色体,GO介绍表示在亚铁组合、亚胺丙氨酸脱羧酶特异性、天冬氨酸1-脱羧酶特异性和人体癌内部接装配负干预中生物生物生物丰度;KEGG介绍表示在2型胃癌、油脂的人体癌内部因素网络信息径路和胰岛素网络信息径路中生物生物生物丰度。在GO介绍中,m6A调整和mRNA调整的人类染色体在寡肽组合、谷胱甘肽组合和二硫腐蚀物腐蚀替换酶特异性中生物生物生物丰度,而在KEGG介绍中,它在柚子酸循坏(TCA循坏)、丙酸基础分解消化吸收转化转化和多动物群凋亡中生物生物生物丰度。在GO介绍中,m6A调整和mRNA调涨的人类染色体在胚胎骨肘关节型态产生、蛋白酶激酶特异性刺激和NADP基础分解消化吸收转化转化的整个环节中生物生物生物丰度,在KEGG介绍中,m6A调整和mRNA调涨人类染色体在新霉素、卡那霉素和精神养分因素网络信息径路中生物生物生物丰度。

图5| m6A甲基化与mRNA传达的结合分析一下

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG阐述

拜谱生物技术个人总结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱动物提供了m6A甲基化技术设备服务项目,拜谱海洋生物可提供完善成熟的蛋白质组学、基础代谢组学、转录组学、多个学连合的产品系统服务管理,欢迎致电咨询!

考虑论文毕业论文:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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