
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用淡化血清组学产品,实现1000+玄之又玄度突显位点检测出,安全稳定初现特色靶点,全位置生信剖析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“察觉”到“印证”全注意事项工作,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、实验英文方案
02、亲测信息
03、经“点”重演
在亲测信息中,检测出多条学术论文中新闻稿的经典传奇靶点举例衣康酸掩盖位点,如第一次个被感觉的衣康酸共价掩盖核核蛋白酶KEAP1,再有糖酵解径路中的3个重中之重性酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,甚至炎性小体组成的核核蛋白酶NLRP3和癌细胞病变工作中的重中之重性核核蛋白酶RIPK3等,其质谱图以下图表达。
04、护肤品特别
1.多大质控
商家化特男人查重器孵育、SDS-PAGE查重、WB效验、样版相应的性讲解等多方面位查重,保持项目流程报告安全性。2.高效能质谱器材app平台
在Orbitrap Astral全新新一波的高辩认质谱仪提升下,保证衣康碱化表达位点及核蛋白认定新淬硬层,电子助力数学学习新找到。3.全过程一坐式服务于
系统设计拜谱怪物建立完善的实验室app平台,可可以提供“生殖细胞锻炼→检侧器孵育→WB检侧→艰深度衣康硝化作用表达检侧→独有生信定量分析→既定位点PRM认可”全具体流程安全服务,省时省功更先问。05、研究信息(部份)
06、广泛应用定位
PART 2、文章共享
论文资料一
用英语名称:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文字幕一级标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
研究方案内部:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
资料二
英语问题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文名字标题文字:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
研究分析相关内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、范例衍化难点
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13还具有强些的底物紧密结合作用,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物工程衣康酸性反应表达组试验数据报告中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应表达(下面的图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人心得体会
当做TCA反复的中的正中间分泌率物,衣康酸监测分泌率、免疫力抗体检测和发炎之間的互相能力,为根治免疫力抗体检测发炎病症症状作为了代换根治方法。衣康酸设备构造中的亲电性α,β-不饱合羧酸设备构造能对血清质上的特异性半胱氨酸残基实施烷基化掩盖(迈克尔暴击伤害发应),该翻译资料后掩盖被叫做“衣康酸掩盖(itaconation)”,以致直接影响血清质作用,监测免疫力抗体检测初次应答和分泌率经过,为很多消化道疾病症状性药物研制开发作为新一个构想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应体现血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床医学丝毫一定量靶点代谢率组(QMT1000)或势能新陈基础代谢靶向疗法新陈基础代谢组软件对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
参考选取医学文献
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.